Two new teaching units will be introduced in 2026 :

• ​Introduction to metagenomics 

La métagénomique est une technique qui permet l’étude des génomes microbiens directement à partir d’échantillons environnementaux, sans nécessiter d’isolement ou de culture des micro-organismes. Grâce aux technologies de séquençage haut-débit et aux analyses bio-informatiques avancées, cette approche révolutionne notre compréhension de la diversité microbienne et de ses rôles dans différents écosystèmes. La métagénomique permet d’explorer la diversité microbienne : La majorité des micro-organismes ne peuvent pas être cultivés en laboratoire, la métagénomique permet donc d’accéder à la totalité du microbiome d’un environnement donné (sol, océan, intestin humain, etc.). Elle permet d’étudier les relations symbiotiques, compétitives ou pathogènes entre les microbes et leurs hôtes. En analysant le microbiote humain ou les écosystèmes naturels, cette approche aide à comprendre l’impact des maladies, des polluants ou des changements climatiques sur les communautés microbiennes.

La métagénomique est ainsi un outil puissant qui transforme la microbiologie et ouvre de nouvelles perspectives dans des domaines variés, allant de la santé humaine à l’écologie en passant par l’industrie et l’agriculture.

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• Single-cell omics and spatial transcriptomics

   

​Le scRNAseq, ou séquençage de l'ARN à cellule unique, est une avancée majeure dans le domaine de la génomique. Cette technique permet d'étudier l'expression génique au niveau d'une cellule individuelle, offrant ainsi une vue détaillée de la diversité et de l'hétérogénéité cellulaire au sein d'une population. Grâce au scRNAseq, nous pouvons identifier des sous-populations cellulaires, comprendre les différences fonctionnelles entre elles et explorer les mécanismes de régulation à l'échelle cellulaire.

La transcriptomique spatiale permet d’analyser l’expression des gènes tout en préservant l’organisation spatiale des cellules dans un tissu. Contrairement à la transcriptomique classique, qui dissocie les cellules et perd l’information sur leur localisation, cette approche offre une vision plus précise des processus biologiques en contexte tissulaire. Grâce à la transcriptomique spatiale, il est possible de cartographier l’expression des gènes dans un tissu avec une résolution fine. Ainsi il est désormais possible d’étudier l’hétérogénéité cellulaire, notamment en cancérologie, en neurosciences ou en immunologie, en conservant les interactions entre les cellules et leur micro-environnement.

Ces deux technologies récentes ouvre de nouvelles perspectives pour la recherche biomédicale, notamment dans l'étude de l'hétérogénéité des tumeurs et le développement de traitements personnalisés.